¿Qué puedo hacer ante un despido a una mujer embarazada?

Buenos días, intentaré ser lo más breve posible. Ayer echaron a mi novia del trabajo, ella está embarazada de 10 semanas. El día fue de esta manera: ella comenzó a las 8 de la mañana a trabajar y a las 9 llegó su jefa y le pidió si podría irse un poco antes ya que por una parte le deben horas de ella que ha hecho de más y aparte porque ella se encontraba mal, por lo que le dijo la jefa que le diera un rato a que se organizaran el día y le diría cuándo se podría ir. Llega la hora poder irse en lo que antes de irse le dice la jefa que si puede ir un momento a su despacho para hablar sobre temas de trabajo y mi novia contesta que ningún problema y se encuentra el despido encima de la mesa, en lo que ella ya se puso mal por todo el esfuerzo que ha hecho en esta empresa donde está y bien escondido entre las hojas le colaron un mutuo acuerdo donde ella aceptaba que le indemnizaran con una suma y no podría reclamar nada más. El estado de mi novia cada vez es peor y allí es donde aprovecha la jefa en decirle ''si no firmas, no te arreglo el paro y no podrás cobrar para tu hijo''. Y mi novia en ese momento solo pensó por nuestro hijo que está en camino, en lo que salió del trabajo llorando y se fue directamente al médico de cabecera y tenemos un parte médico donde dice bien claro que llega con un cuadro ansiolítico y tiene una hemorragia interna y nos derivan al hospital y nos han dado la baja por enfermedad común antes de que ellos hicieran la baja de la Seguridad Social. La pregunta es la siguiente ¿ellos le pueden dar de baja de la Seguridad Social con el mutuo acuerdo habiendo una baja del médico? ¿Alguien nos puede ayudar y asesorar sobre qué pasos seguir?
Gracias. Debo aclarar que ella tenía un contrato de Obra y Servicio y no hay finalidad de servicio porque siguen trabajando y están contratando a gente nueva por la temporada de verano.